مجله گیاه پزشکی مقاله­ های تحقیقی و نتایج تحقیقات در زمینه بیماری شناسی گیاهی و علوم وابسته به آن و همچنین آفات کشاورزی و رشته ­های مرتبط با آن که به زبان فارسی نوشته شده و قبلاٌ به هیچ طریق انتشار نیافته و یا همزمان به مجلات دیگر فرستاده نشده باشند را پس از داوری علمی و ادبی پذیرفته و منتشر می ­کند. مقالاتی که خلاصه آن ها در مجامع علمی داخلی و خارجی چاپ شده باشد مستثنی هستند. در هر شماره از مجلــه درصورت دریافت مقاله هائی به صورت مقالــه کوتاه علمی و یا گــزارش کـوتاه علمـی به چاپ خواهد رسید (حداکثر 2 مقاله). مقالات مروری (Review) نیز که توسط اساتید یا پژوهندگان با تجربه و متخصص تهیه شده باشند قابل چاپ در مجله هستند.